本市漁業年產量約2,188公噸，產值約4.77億元，以沿近海漁業為主，從業漁民約4,400餘人，漁獲有白帶魚、鰆魚(土魠)、午仔魚、烏魚、白姑魚(帕頭仔)等魚類及蝦蟹類。

    本市漁港由北而南有松柏漁港、五甲漁港、北汕漁港、塭寮漁港、梧棲漁港及麗水漁港等6個漁港，其中梧棲漁港為中央管第一類漁港，並委由本府代為管理，其他漁港為市轄第二類漁港。